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现代军舰作战不仅要应对来自水上水下的各种鱼雷导弹，强烈的电磁干扰，复杂的战场环境，甚至还要应付来自太空外的威胁！
一艘水面舰艇除了有强有力的打击能力之外，其自身的防御能力当然不容忽视，让其足以应对各种威胁。
现如今我们最常见的有干扰弹发射器，扰乱来袭导弹。近防炮，和防空导弹用来击毁来袭导弹。反潜深弹，鱼雷，拖曳声纳，用来应付水下威胁。
现在主要回答题主所述问题，面对来袭导弹除了常用干扰弹和近防炮之外，未来可增加激光武器应对来袭导弹。美国已经开始着手将激光武器平台安装在军舰上，激光武器相对于几万到几十万美元的防空导弹来说简直是物美价廉，发射一次仅需要几百美元，而且只要功率够大甚可以摧毁卫星。
早在2014年时美国就公布了成功测试了一款激光武器，到2017年美军在波斯湾用激光武器成功击落一架无人机，见上图！可见激光武器在未来战争中所起到的重要作用！
个人认为激光武器将来一定会成为主力防御武器，不知道大家怎么看?原创不易，谢谢大家支持！欢迎大家交流！
现代军舰防范袭来的敌方导弹，最主要的防御武器就是干扰火箭，基本原理就是制造假目标、干扰敌方导弹。
不同于通常发挥战斗、破坏作用的弹药，干扰火箭（或者叫火箭干扰弹）的主要功能是迷惑敌方来袭的导弹。
现代反舰导弹飞向目标时的末端制导方式，主要有雷达制导、红外线制导等方式，火箭干扰弹正是与之争锋相对。
其中一种是填装金属干扰丝、金属箔片，发射后在军舰侧上空外围形成一定范围的金属反射云，从而干扰敌方雷达侦测，使敌方雷达错误地将导弹引导到金属云区域爆炸。
另外一种主要是热焰弹，发射后在军舰外围剧烈燃烧，从而误导敌方红外制导的反舰导弹。
（干扰火箭防御雷达制导导弹的步骤示意图。图一发射干扰弹；图二干扰弹爆炸形成金属云，敌导弹被错误导引向金属云方向；图三，敌导弹在金属云区域爆炸。图片来源：[日]森恒英：《续舰船メカニズム图鉴》,1991年版）
目前各国海军中，比较常见的是筒装的干扰火箭发射装置，一般是多联装，有的类似多联装的掷弹筒，诸如美国海军的SRBOC系统（Super Rapid Bloom Off-Board Countermeasures，直译为舷外快速撒布系统）的MK36发射装置，也有的类似多管火箭炮，诸如人民海军装备的726-4型发射装置，以及台湾地区海军装备的CR-201型干扰火箭发射装置。另外也有一些怪力乱神的特殊设计，例如法国的“达盖”Dagaie干扰火箭发射系统，采用的是多弹种混转的箱体式。
（西方海军装备十分普遍的美国SRBOC MK32反潜火箭6管发射装置）
（外形类似多管火箭炮的人民海军726-4型18管干扰火箭发射装置）
（台湾地区研发生产的CR-201型16管干扰火箭发射装置）
（结构非常特殊的法国“达盖”MKII反潜火箭发射装置）
现在，各种类型的反舰导弹层出不穷，空对舰、舰对舰、潜对舰、岸对舰等花样繁多，对现代水面作战舰艇的威胁越来越大，但战舰也不可能任由反舰导弹肆意妄为地打击，一定会有自身的防护手段。
目前，水面舰艇对不同方向来袭的反舰导弹，主要有被动防御和主动防御两大类防御手段，多重应对措施，来确保战舰的安全。
先说被动防御，即对来袭的反舰导弹进行软对抗，主要是施放干扰弹，由舰载多管火箭发射器发射，弹体内置金属箔条、金属铝干扰丝等，爆炸时在舰艇周围上空形成金属反射云，干扰敌主动寻的雷达，诱骗来袭的反舰导弹在此区域爆炸，从而保证己方水面舰艇的安全。
此外，也可发射热焰弹，即通过投放燃烧铝镁等燃点低的金属，让其产生大量热量，产生一个新的热源，用来干扰红外导弹的攻击，最初是装在战斗机上的，军舰上也有此类装备，但并不普遍，因为反舰导弹多以主动雷达、半主动雷达寻的为主，红外制导的反舰导弹有，但不是主流。
主动防御，即对来袭的反舰导弹，进行有效拦截，主要有舰炮打击，近防炮末端拦截，以及防空导弹拦截等数道火力网，确保战时水面舰艇安全。
国外奥拓舰炮的DART炮弹，国内76毫米舰炮，也有类似奥拓的DART炮弹，由激光近炸引信、姿态传感器、控制处理器、指令接受器、战斗部、及尾翼部件等组成，用于对来袭反舰导弹的拦截，据称效果相当好，特别是76毫米舰炮，已成了海军反导的有力武器。
近年来，在海军多次组织的实战背景下的军演中，76毫米舰炮皆有出色的防空反导表现，令海军方面非常满意。
近防炮系统，主要用于对来袭的反舰导弹进行拦截，是水面舰艇末端最后一道防线，国内外主战舰艇上都有安装，对载舰意义重大，是确保载舰安全的最后手段。
防空导弹拦截，一般当代的远程中程近程防空导弹，基本上都具备拦截反舰导弹的能力，战时为保证大中型水面舰艇的安全，在发现来袭的反舰导弹时，都会采有先远程防空导弹拦截，失效时，再用中程防空导弹或舰炮拦截，未果时，就有近程防空导弹拦截，当再次失效时，就有近防炮系列拦截，如果还是拦不下来，那只能呜呼哀哉了。
国平军史总结，尽管反舰导弹对水面舰艇的威胁非常严重，但水面舰艇也有被动和主动两重防御体系，来确保载舰的安全，但当被动防御体系和主动防御体系，都被来袭的反舰导弹刺破，那也是听天由命了，因为世界上不存在打不沉的战舰。
但通过以上被动防御体系，主动防御体系中的舰炮打击、远中近三重导弹拦截、最终近防炮拦截，水面舰艇的安全，基本上能得到一定保证了。
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